ptxNinja è un plugin architetturale che estende le funzionalità di Binary Ninja per supportare file *.ptx contenenti funzioni o kernel scritti in PTX. Il linguaggio PTX è un formato di basso livello utilizzato da NVDIA per le proprie GPU basate su architetture CUDA. Questo plugin consente di avere un lifter che traduce istruzioni grezze in istruzioni nel formato di basso livello (LLIL) che Binary Ninja necessita per avviare le analisi.